También por esa época empezó a correr la noticia de que un grupo de incas había huido del Cuzco después de la prisión de Atahualpa; internándose en una región montañosa del Sur y llevando enormes riquezas. Así comienza la leyenda de la Ciudad de los Césares, en alusión a Francisco César. La historia siguió haciendo sus aportes: en 1534, la expedición de Simón Alcázaba dejó náufragos en el estrecho de Magallanes, al igual que la de Francisco de Camargo (el Obispo de Plascencia) en 1539, y el fallido intento de colonización del estrecho realizado por Sarmiento de Gamboa en 1584.
    ¡Cada vez mas gente desaparecida en la Patagonia y de la que no se había vuelto a tener noticias! Ruy Díaz de Guzmán, el primer cronista mestizo del Río de la Plata y del Paraguay, en su libro La Argentina escrito en 1612; se hace eco de estas leyendas y tras escribir un itinerario imposible, que incluía desde Magallanes hasta el Cuzco, cuenta acerca de César y sus hombres que:

    Chatwin cuenta que una descripción del siglo XVIII situaba la ciudad al sur de la latitud 45° y la presentaba como una fortaleza enclavada en las montañas, al pie de un volcán y a orillas de un hermoso lago. Por su parte Renato Cárdenas Álvarez en El libro de la mitología, la ubica en el sector cordillerano, entre el lago Nahuel Huapi y el lago Viedma (esto sería entre los 41° y los 50° de latitud sur).
    Numerosas expediciones militares fueron en busca de la ciudad, así como también muchos expedicionarios solitarios. En 1665, el jesuita Nicolas Mascardi cruzó los Andes y se dirigió hacia el sur hasta llegar a una latitud estimada de 46°, donde encontró un gran lago, probablemente el Buenos Aires, pero ningún rastro de la Ciudad de los Césares. Años más tarde unos indios, en agradecimiento porque los había liberado de la esclavitud; prometieron a Mascardi llevarlo hasta el lugar buscado y así llegó hasta el lago Nahuel Huapi donde estableció una Misión. Guiado por su deseo de descubrir la Ciudad Dorada acompañó a una india llamada "la reina" hacia el sur, probablemente hasta la zona de Esquel. Pero la mujer no permitió ir más al sur porque dijo que previamente debía tener autorización de los Césares. Mascardi que no estaba seguro de cuál sería el idioma de los Césares, escribió cartas en griego, latín, italiano, araucano y colla, pero más tarde retornaron los mensajeros diciendo que habían sido atacados por enemigos y que las cartas fueron robadas. En 1672 llegó al Cabo Vírgenes en el Atlántico y en 1673 fue muerto por flechas indias cuando se dirigía en una expedición hacia el Estrecho de Magallanes.

    Ya en 1774 Tomás Falkner en su Descripción de la Patagonia apela más a la razón: "El cuento aquel de que existe una nación en esta tierra, de origen europeo procedente de un naufragio, es a mi entender enteramente falso y sin fundamento...Y lo que hace aun más increíble que haya existido una ciudad de los Césares, es la imposibilidad absoluta que europeos, ni aun cuando fuese en número de 200 ó 300, casi todos hombres, sin comunicación alguna con país civilizado, hubiesen podido penetrar a través de tan numerosas y tan guerreras naciones, mantenerse como república aparte en tierra que de suyo nada ofrece, en que los habitantes sólo viven de la caza, y aun más por el espacio de 200 años sin haber sido exterminados."
    Las descripciones de la Ciudad Encantada de la Patagonia son mas o menos coincidentes. Estaba en medio de una laguna llamada Payegüé, cerca de un estero correntoso y profundo; tenía murallas con fosos, fortificaciones y una sola entrada con puente levadizo. Sus edificios eran lujosos, en piedra labrada, los templos cubiertos de plata maciza, del mismo metal que los utensilios de uso diario y los instrumentos de labranza, los muebles de las casas eran de oro, y los pavimentos de las calles de plata y oro macizos; una gran cruz coronaba la torre de la iglesia y si su campana llegara a tocarse, su tañido se oiría en el mundo entero. Sus habitantes eran blancos y rubios, con ojos azules y barba espesa, vestían casacas de paño azul, calzones de buché, capas amarillas y sombreros de tres picos, y hablaban un idioma ininteligible. No era dado a ninguna persona descubrirla aun cuando la estuviese pisando, una niebla espesa se interpone entre ella y el viajero, y la corriente de los ríos que la batían refluye para alejar las embarcaciones. Sólo al fin del mundo la ciudad se haría visible para convencer a los incrédulos que dudaron de su existencia.
    Todo suena a leyenda... pero increiblemente aún entrados los años ochenta del siglo XX existieron proyectos de expedición que pedían autorización y asistencia a Gendarmería Nacional... con el fin de localizar siquiera los restos del La Ciudad Dorada de los Césares.-